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HEPA फ़िल्टर ≥0.3μm कणों के लिए ≥99.97% दक्षता प्राप्त करते हैं, जबकि ULPA फ़िल्टर ≥0.1μm कणों के लिए ≥99.9995% दक्षता के साथ बेहतर प्रदर्शन प्रदान करते हैं। यह ULPA को ISO क्लास 3 वातावरण (जैसे, सेमीकंडक्टर फैब्रिकेशन) के लिए आदर्श बनाता है, जबकि HEPA ISO क्लास 5 ज़ोन (जैसे, फार्मास्युटिकल क्लीनरूम) के लिए पर्याप्त है। ULPA द्वारा सबमाइक्रोन कणों (उदाहरण के लिए, 60-140nm पर SARS-CoV-2 जैसे वायरस) की बढ़ी हुई पकड़ बीएसएल-4 प्रयोगशालाओं जैसे उच्च जोखिम वाले क्षेत्रों में महत्वपूर्ण सुरक्षा प्रदान करती है।
HEPA फ़िल्टर आमतौर पर ULPA (100-250Pa) की तुलना में कम प्रारंभिक प्रतिरोध (150-250Pa) प्रदर्शित करते हैं, जिससे HVAC प्रणालियों में ऊर्जा की खपत कम हो जाती है। हालाँकि, ULPA का विस्तारित जीवनकाल (24 महीने तक बनाम HEPA का 12-18 महीने) उच्च अग्रिम लागत की भरपाई करता है। अध्ययनों से पता चलता है कि ULPA के मिनी-प्लीटेड डिज़ाइन 10Pa तक दबाव में कमी ला सकते हैं, जिससे 3,400m³/h एयरफ़्लो पर प्रति फ़िल्टर ~113kWh सालाना बचत होती है।
HEPA फिल्टर आईसीयू और सर्जरी रूम (H13-H14 ग्रेड) में मानक हैं, जबकि ULPA BSL-4 प्रयोगशालाओं और सेमीकंडक्टर "क्लीनरूम आइलैंड्स" के लिए अनिवार्य है। केस अध्ययनों से पता चलता है कि दोहरे चरण HEPA (H13+H14) अस्पतालों में ISO कक्षा 5 प्राप्त करता है, जबकि ULPA+Ag⁺ फ़िल्टर (उदाहरण के लिए, JV-BioFilter) को वायरल रोकथाम के लिए वुहान P4 लैब में तैनात किया गया है। मॉड्यूलर क्लीनरूम अक्सर दोनों को मिलाते हैं: सामान्य क्षेत्रों के लिए HEPA और महत्वपूर्ण वर्कफ़्लो के लिए ULPA।

